植物生理生态研究所（筹，分子植物科学卓越创新中心)是中科院最早建成的研究所之一，我国第一批获得博士学位授予资格的研究所，科学创新文化底蕴深厚，科研进展活跃。2015年7月中国科学院批准建立分子植物科学卓越创新中心。中心由中科院上海植物生理生态研究所和中科院上海植物逆境生物学研究中心两个招生单元组成，面向国家粮食生产和生态环境安全的重大战略需求，聚焦植物遗传多样性、植物生长发育调控和植物与环境互作机理等关键科学问题，在植物、微生物和昆虫研究领域，开展基础性、前沿性和原创性的研究，以期达到前沿科学研究领域的国际领先地位，建设成为国际一流的植物分子科学研究中心，为现代农业、生态环境和人民健康服务。 研究所拥有一支结构优化、国际水平的科研队伍，包括中国科学院院士9人， “顶尖千人”入选者1人，“千人计划”创新长期项目入选者2人，“青年千人计划”入选者15人，国家“万人计划”领军人才入选者4人，中青年科技创新领军人才入选者5人，中国科学院“百人计划”入选者31人，国家杰出青年科学基金获得者13人，研究员及正高级工程技术人员93人，副研究员及高级工程技术人员100人。全所现有职工近500人，在学研究生573人（其中硕士生213人、博士生360人）、在站博士后100余人。