中国科学院生态环境研究中心考研导师邓晔介绍
作者：科大科院考研网 发表时间：2019-09-29 来源：研招办
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邓晔 男 博导 中国科学院生态环境研究中心
电子邮件： yedeng@rcees.ac.cn
通信地址： 北京市海淀区双清路18号
邮政编码： 100085
研究领域
教育背景
2007-08--2009-07 美国俄克拉荷马大学 博士后
2002-08--2007-06 浙江大学 博士
1998-09--2002-06 中南大学 学士
2002-08--2007-06 浙江大学 博士
1998-09--2002-06 中南大学 学士
学历
学位
工作经历
工作简历
2009-09~2014-01,美国俄克拉荷马大学, 研究科学家
社会兼职
2017-01-01-今,BMC Microbiology杂志, 编辑
2016-01-01-今,国际微生物生态学会, 中国青年大使
2016-01-01-今,Frontiers in Microbiology杂志, 编辑
2014-08-01-今,中国生态学会微生物生态专业委员会, 委员
2016-01-01-今,国际微生物生态学会, 中国青年大使
2016-01-01-今,Frontiers in Microbiology杂志, 编辑
2014-08-01-今,中国生态学会微生物生态专业委员会, 委员
教授课程
现代环境生物技术
分子生物学在环境生物技术中的应用
分子生物学在环境生物技术中的应用
专利与奖励
奖励信息
（1） 优秀研究员, 特等奖, 研究所（学校）, 2013
（2） 优秀研究员, 特等奖, 研究所（学校）, 2012
（3） 优秀研究员, 特等奖, 研究所（学校）, 2011
（4） 2010年度创新奖, 特等奖, 省级, 2010
（5） 优秀研究员, 特等奖, 研究所（学校）, 2010
（6） R&D100, 特等奖, 国家级, 2009
（2） 优秀研究员, 特等奖, 研究所（学校）, 2012
（3） 优秀研究员, 特等奖, 研究所（学校）, 2011
（4） 2010年度创新奖, 特等奖, 省级, 2010
（5） 优秀研究员, 特等奖, 研究所（学校）, 2010
（6） R&D100, 特等奖, 国家级, 2009
专利成果
出版信息
发表论文
（1） The microbially-mediated soil organic carbon loss under degenerative succession in an alpine meadow, Molecular Ecology, 2017, 通讯作者
（2） Reply to "Pseudoreplication in a continental-scale forest soil microbial diversity study”, Nature Communications, 2017, 通讯作者
（3） Thirty-one years of Rice-Rice-Green Manure rotations shape the rhizosphere microbial community and enrich beneficial bacteria, Soil Biology & Biochemistry, 2017, 通讯作者
（4） Responses of soil microbial functional genes to global changes are indirectly influenced by aboveground plant biomass variation, Soil Biology & Biochemistry, 2017, 通讯作者
（5） Soil microbial quantification approaches coupling with relative abundances reflecting the changes of taxa in different locations, Scientific Reports, 2017, 通讯作者
（6） Elevated carbon dioxide accelerates the spatial turnover of soil microbial communities, Global Change Biology, 2016, 第 1 作者
（7） Characterization and genomic analysis of a highly efficient dibutyl phthalate-degrading bacterium Gordonia sp. strain QH-12, International Journal of Molecular Sciences, 2016, 通讯作者
（8） Patulibacter brassicae sp. nov., isolated from rhizosphere soil of Chinese cabbage (Brassica campestris), International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2016, 通讯作者
（9） Network succession reveals the importance of competition in response to emulsified vegetable oil amendment for uranium bioremediation, Environmental Microbiology, 2016, 第 1 作者
（10） Temperature mediates continental-scale diversity of microbes in forest soils, Nature Communications, 2016, 通讯作者
（11） Biogeographic patterns of soil diazotrophic communities across six forests in the North America, Molecular Ecology, 2016, 第 2 作者
（12） s there a distance-decay relationship in biological wastewater treatment plants?, Applied and environmental microbiology, 2016, 第 3 作者
（13） Scale-dependent effects of climate and geographic distance on bacterial diversity patterns across northern China’s grasslands, FEMS Microbiology Ecology, 2016, 第 3 作者
（14） 功能微生物群落在乙醇类燃料泄漏过程中的演变, Succession of microbial functional communities in response to a pilot-scale ethanol-blended fuel release throughout the plume life cycle, Environmental Pollution, 2015, 第 2 作者
（15） 使用宏基因组和网络分析揭示土壤微生物在森林林线附近的分布, Integrated metagenomics and network analysis of soil microbial community of the forest timberline, Scientific Reports, 2015, 第 3 作者
（16） 三峡大坝对微生物群落和潜在功能的影响, Impacts of the Three Gorges Dam on microbial structure and potential function, Scientific Reports, 2015, 第 3 作者
（17） 高通量宏基因组技术用于微生物群落分析：开放和封闭体系, High-Throughput Metagenomic Technologies for Complex Microbial Community Analysis: Open and Closed Formats, mBio, 2015, 第 4 作者
（18） 真菌群落对长期二氧化碳升高的反应, Fungal communities respond to long-term elevated CO2 by community reassembly, Applied and environmental microbiology, 2015, 第 4 作者
（19） 随机性因素对水生生态系统的连续影响, Stochasticity, Succession and Environmental Perturbations in Fluidic Ecosystems, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2014, 第 2 作者
（20） 土壤微生物在大豆农业生态系统中对二氧化碳和臭氧升高的直接反应, Distinct responses of soil microbial communities to elevated CO2 and O3 in a soybean agro-ecosystem, The ISME Journal, 2014, 第 4 作者
（21） GeoChip4用于分析微生物群落的功能基因芯片, GeoChip 4: a functional gene-array-based high-throughput environmental technology for microbial community analysis, Molecular Ecology Resources, 2014, 第 3 作者
（22） 中国东部农田氨氧化细菌和古菌的纬度分布特征, Latitudinal Distribution of Ammonia-Oxidizing Bacteria and Archaea in the Agricultural Soils of Eastern China, Applied and environmental microbiology, 2014, 第 3 作者
（23） 开发HuMiChip检测人体微生物群落的功能特征, Development of HuMiChip for Functional Profiling of Human Microbiomes, PloS One, 2014, 通讯作者
（24） 菌株或者菌种特异探针设计, Strain/Species-Specific Probe Design for Microbial Identification Microarrays, Appl. Environ. Microbiol, 2013, 第 3 作者
（25） StressChip作为检测环境逆境中微生物群落反应的工具, StressChip as a High-Throughput Tool for Assessing Microbial Community Responses to Environmental Stresses, Environmental Science and Technology, 2013, 通讯作者
（26） 二氧化碳升高引起土壤微生物群落结构变化, Elevated carbon dioxide alters the structure of soil microbial communities, Appl. Environ. Microbiol, 2012, 第 1 作者
（27） 分子生态网络分析, Molecular Ecological Network Analyse, BMC Bioinformatics, 2012, 第 1 作者
（28） 深海原油泄漏引起微生物功能基因富集, Microbial gene functions enriched in the Deepwater Horizon deep-sea oil plume, The ISME Journal, 2012, 第 2 作者
（29） 臭氧升高改变了小麦根际周边微生物群落的功能基因表型, Shifts of functional gene representation in wheat rhizosphere microbial communities under elevated ozone, The ISME Journal, 2012, 第 2 作者
（30） 微生物介导的全球升温中碳循环的反馈效应, Microbial mediation of carbon-cycle feedbacks to climate warming, Nature Climate Change, 2012, 第 4 作者
（2） Reply to "Pseudoreplication in a continental-scale forest soil microbial diversity study”, Nature Communications, 2017, 通讯作者
（3） Thirty-one years of Rice-Rice-Green Manure rotations shape the rhizosphere microbial community and enrich beneficial bacteria, Soil Biology & Biochemistry, 2017, 通讯作者
（4） Responses of soil microbial functional genes to global changes are indirectly influenced by aboveground plant biomass variation, Soil Biology & Biochemistry, 2017, 通讯作者
（5） Soil microbial quantification approaches coupling with relative abundances reflecting the changes of taxa in different locations, Scientific Reports, 2017, 通讯作者
（6） Elevated carbon dioxide accelerates the spatial turnover of soil microbial communities, Global Change Biology, 2016, 第 1 作者
（7） Characterization and genomic analysis of a highly efficient dibutyl phthalate-degrading bacterium Gordonia sp. strain QH-12, International Journal of Molecular Sciences, 2016, 通讯作者
（8） Patulibacter brassicae sp. nov., isolated from rhizosphere soil of Chinese cabbage (Brassica campestris), International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2016, 通讯作者
（9） Network succession reveals the importance of competition in response to emulsified vegetable oil amendment for uranium bioremediation, Environmental Microbiology, 2016, 第 1 作者
（10） Temperature mediates continental-scale diversity of microbes in forest soils, Nature Communications, 2016, 通讯作者
（11） Biogeographic patterns of soil diazotrophic communities across six forests in the North America, Molecular Ecology, 2016, 第 2 作者
（12） s there a distance-decay relationship in biological wastewater treatment plants?, Applied and environmental microbiology, 2016, 第 3 作者
（13） Scale-dependent effects of climate and geographic distance on bacterial diversity patterns across northern China’s grasslands, FEMS Microbiology Ecology, 2016, 第 3 作者
（14） 功能微生物群落在乙醇类燃料泄漏过程中的演变, Succession of microbial functional communities in response to a pilot-scale ethanol-blended fuel release throughout the plume life cycle, Environmental Pollution, 2015, 第 2 作者
（15） 使用宏基因组和网络分析揭示土壤微生物在森林林线附近的分布, Integrated metagenomics and network analysis of soil microbial community of the forest timberline, Scientific Reports, 2015, 第 3 作者
（16） 三峡大坝对微生物群落和潜在功能的影响, Impacts of the Three Gorges Dam on microbial structure and potential function, Scientific Reports, 2015, 第 3 作者
（17） 高通量宏基因组技术用于微生物群落分析：开放和封闭体系, High-Throughput Metagenomic Technologies for Complex Microbial Community Analysis: Open and Closed Formats, mBio, 2015, 第 4 作者
（18） 真菌群落对长期二氧化碳升高的反应, Fungal communities respond to long-term elevated CO2 by community reassembly, Applied and environmental microbiology, 2015, 第 4 作者
（19） 随机性因素对水生生态系统的连续影响, Stochasticity, Succession and Environmental Perturbations in Fluidic Ecosystems, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2014, 第 2 作者
（20） 土壤微生物在大豆农业生态系统中对二氧化碳和臭氧升高的直接反应, Distinct responses of soil microbial communities to elevated CO2 and O3 in a soybean agro-ecosystem, The ISME Journal, 2014, 第 4 作者
（21） GeoChip4用于分析微生物群落的功能基因芯片, GeoChip 4: a functional gene-array-based high-throughput environmental technology for microbial community analysis, Molecular Ecology Resources, 2014, 第 3 作者
（22） 中国东部农田氨氧化细菌和古菌的纬度分布特征, Latitudinal Distribution of Ammonia-Oxidizing Bacteria and Archaea in the Agricultural Soils of Eastern China, Applied and environmental microbiology, 2014, 第 3 作者
（23） 开发HuMiChip检测人体微生物群落的功能特征, Development of HuMiChip for Functional Profiling of Human Microbiomes, PloS One, 2014, 通讯作者
（24） 菌株或者菌种特异探针设计, Strain/Species-Specific Probe Design for Microbial Identification Microarrays, Appl. Environ. Microbiol, 2013, 第 3 作者
（25） StressChip作为检测环境逆境中微生物群落反应的工具, StressChip as a High-Throughput Tool for Assessing Microbial Community Responses to Environmental Stresses, Environmental Science and Technology, 2013, 通讯作者
（26） 二氧化碳升高引起土壤微生物群落结构变化, Elevated carbon dioxide alters the structure of soil microbial communities, Appl. Environ. Microbiol, 2012, 第 1 作者
（27） 分子生态网络分析, Molecular Ecological Network Analyse, BMC Bioinformatics, 2012, 第 1 作者
（28） 深海原油泄漏引起微生物功能基因富集, Microbial gene functions enriched in the Deepwater Horizon deep-sea oil plume, The ISME Journal, 2012, 第 2 作者
（29） 臭氧升高改变了小麦根际周边微生物群落的功能基因表型, Shifts of functional gene representation in wheat rhizosphere microbial communities under elevated ozone, The ISME Journal, 2012, 第 2 作者
（30） 微生物介导的全球升温中碳循环的反馈效应, Microbial mediation of carbon-cycle feedbacks to climate warming, Nature Climate Change, 2012, 第 4 作者
发表著作
（ 1 ） 分子生态网络分析, Molecular ecological network analysis, Springer, 2014-06, 第 1 作者
（ 2 ） 生物芯片数据分析, Microarray data analysis, Horizon Scientific Press, 2014-06, 第 1 作者
（ 2 ） 生物芯片数据分析, Microarray data analysis, Horizon Scientific Press, 2014-06, 第 1 作者
科研活动
科研项目
（ 1 ） 生产过程中抗生素与抗药基因的排放特征、环境行为及控制技术, 参与, 国家级, 2015-01--2019-12
（ 2 ） 典型森林土壤微生物空间格局及驱动机制, 参与, 部委级, 2014-01--2018-12
（ 3 ） 东江高度集约开发区域水质风险控制与水生态功能恢复技术集成及综合示范, 参与, 国家级, 2015-01--2017-12
（ 4 ） 长江流域自然保护区内土壤微生物群落的种-面积关系变化与驱动机制, 主持, 国家级, 2016-01--2016-12
（ 5 ） 污染环境中功能微生物类群的快速识别和原位调控, 主持, 部委级, 2016-09--2020-12
（ 6 ） 北方农牧交错带草地退化形成机理与驱动机制, 参与, 国家级, 2016-07--2020-12
（ 2 ） 典型森林土壤微生物空间格局及驱动机制, 参与, 部委级, 2014-01--2018-12
（ 3 ） 东江高度集约开发区域水质风险控制与水生态功能恢复技术集成及综合示范, 参与, 国家级, 2015-01--2017-12
（ 4 ） 长江流域自然保护区内土壤微生物群落的种-面积关系变化与驱动机制, 主持, 国家级, 2016-01--2016-12
（ 5 ） 污染环境中功能微生物类群的快速识别和原位调控, 主持, 部委级, 2016-09--2020-12
（ 6 ） 北方农牧交错带草地退化形成机理与驱动机制, 参与, 国家级, 2016-07--2020-12
参与会议
（1）微生物群落网络分析在重金属铀污染环境中研究 美国微生物学会2013年度大会 Ye Deng 2013-06-22
（2）微生物群落网络分析 美国微生物学会2011年度大会 Ye Deng 2011-06-22
（2）微生物群落网络分析 美国微生物学会2011年度大会 Ye Deng 2011-06-22
合作情况
Dr. Jizhong Zhou (University of Oklahoma)
Dr. James M. Tiedje (Michigan State University)
Dr. James Hemphill Brown (Univ of New Mexico)
Dr. Joan B. Rose (Michigan State University)
Dr. Terry C. Hazen (LBL, University of Tennessee)
Dr. Rob Knight (University of Colorado)
Dr. Nianzhi Jiao (Xiamen Univ)
Dr. James M. Tiedje (Michigan State University)
Dr. James Hemphill Brown (Univ of New Mexico)
Dr. Joan B. Rose (Michigan State University)
Dr. Terry C. Hazen (LBL, University of Tennessee)
Dr. Rob Knight (University of Colorado)
Dr. Nianzhi Jiao (Xiamen Univ)
项目协作单位
指导学生
现指导学生
魏子艳 01 19368
刘洋荧 02 67011
孔晓 01 19367
王朱珺 01 19367
吴悦妮 01 19367
杜雄峰 02 67011
秦化宇 01 67674
冯凯 01 67674
