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研究领域

单细胞组学是目前生物学研究的前沿技术。本课题组主要通过高通量单细胞转录组测序和表观基因组测序技术,绘制常见细胞系模型的异质性图谱、主要器官的跨物种单细胞图谱以及人体重要器官的单细胞图谱,同时通过生物信息学分析,揭示细胞水平基因表达调控的异质性,特别是选择性剪接、RNA编辑等转录后调控过程在细胞谱系分化、重大疾病如癌症、神经退行性疾病等发生发展过程中的作用机制。

招生信息

   
招生专业
070321-化学生物学
070322-生物无机化学
071022-基因组学
招生方向
单细胞组学分析

教育背景

2014-09--2017-03   丹麦哥本哈根大学生物系   博士
2011-07--2014-01   东南大学生物科学与医学工程学院   硕士
2007-08--2011-06   东南大学生物科学与医学工程学院   本科

工作经历

   
工作简历
2018-06~现在, 深圳华大生命科学研究院, 执行院长
2014-07~2018-06,深圳华大基因研究院, 执行副院长
2010-03~2014-07,深圳华大基因研究院, 生物信息分析工程师
社会兼职
2017-10-09-今,深圳市盐田区田东中学科技副校长, 
2017-09-01-今,深圳市盐田区团委副书记, 

教授课程

单细胞组学分析

专利与奖励

   
奖励信息
(1) 中华医学科技二等奖, 二等奖, 其他, 2014
专利成果
( 1 ) 单细胞分类方法、基因筛选方法及其装置, 发明, 2017, 第 3 作者, 专利号: PCT/CN2012/080578

出版信息

   
发表论文
(1) Whole-genome and transcriptome sequencing of prostate cancer identify new genetic alterations driving disease progression, European Urology, 2017, 第 5 作者
(2) Progress and challenges of sequencing and analyzing circulating tumor cells, Cell Biology and Toxicology, 2017, 通讯作者
(3) Circumventing intratumoral heterogeneity to identify potential therapeutic targets in hepatocellular carcinoma, Journal of hepatology, 2017, 通讯作者
(4) PSSMHCpan: a novel PSSM-based software for predicting class I peptide-HLA binding affinity, GigaScience, 2017, 通讯作者
(5) Population-wide sampling of retrotransposon insertion polymorphisms using deep sequencing and efficient detection, GigaScience, 2017, 通讯作者
(6) Evolution of multiple cell clones over a 29-year period of a CLL patient, Nature communication, 2016, 通讯作者
(7) Frequent alterations in cytoskeleton remodelling genes in primary and metastatic lung adenocarcinomas, Nature Communication, 2016, 第 5 作者
(8) Full-length single-cell RNA-seq applied to a viral human cancer: applications to HPV expression and splicing analysis in HeLa S3 cells, GigaScience, 2015, 通讯作者
(9) Single-cell exome sequencing and monoclonal evolution of a JAK2-negative myeloproliferative neoplasm, Cell, 2012, 第 1 作者
(10) Single-cell exome sequencing reveals single-nucleotide mutation characteristics of a kidney tumor, Cell, 2012, 第 2 作者
发表著作
(1) Single Cell Biomedicine, Spring Nature, 2018-05, 第 5 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 基于多位点微克隆和单细胞多组学的乳腺癌异质性与个体化治疗研究, 参与, 国家级, 2017-01--2020-12
( 2 ) 基于单细胞转录组数据检测RNA编辑位点的生物信息学方法研究, 主持, 省级, 2019-01--2022-01
( 3 ) 以生物组学特征与多模态功能影像为基础的多线束精准放疗方案研究, 参与, 国家级, 2017-01--2022-12
( 4 ) 基于分子影像和影像组学的乳腺癌早诊、疗效评价与预后预测新技术的研发, 参与, 国家级, 2017-07--2020-12
( 5 ) 深圳华大生命科学研究院单细胞组学平台, 主持, 市地级, 2018-01--2023-12
参与会议
(1)Single Cell Sequencing in Cancer   2016-11-01
(2)Single cell sequencing towards precision medicine   2016-06-13

合作情况

本课题组与美国国立癌症研究所Michael Dean教授,丹麦哥本哈根大学Karsten Kristiansen教授,美国斯坦福大学Andreas Keller教授等建立了长期的合作与交流关系,包括互访、学生交换等。

 

 

 


 

 

 

 
 
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