中国科学院上海营养与健康研究院 胡黔楠 男 博导
作者：科大科院考研网 发表时间：2019-12-06 来源：研招办
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细胞工厂设计
定位于微生物细胞工厂设计。致力于为智能生物制造提供信息决策流程化服务，以生物合成、制造相关的大数据研究为基础，解决大宗化学品、生物基产品以及高附加值天然药物的细胞工厂设计的核心科技问题，开发细胞工厂设计流程化系统，创造符合工业化需求的工业菌种。部分在线工作见于实验室网站：http://www.rxnfinder.org，以及http://www.ditad.org。
招生信息
基于研究组已有的信息化系统，进行相关模块的完善、拓展和应用。
具有国内外著名院校或研究机构授予的生物信息学、计算生物学、系统生物学、分子生物学、微生物学、生物化学、天然药物化学等相关专业的学士及以上学位，在系统生物学、合成生物学、代谢工程等方面有较强的科研背景，有从事信息导向细胞工厂设计与应用的兴趣。
有较强的工作责任心、组织协调能力和团队协作精神；具有独立开展科研工作的能力；有强烈的科研兴趣，语言表达与写作能力较好。
课题组急需多个专业、多种层次人才的加盟。
具有国内外著名院校或研究机构授予的生物信息学、计算生物学、系统生物学、分子生物学、微生物学、生物化学、天然药物化学等相关专业的学士及以上学位，在系统生物学、合成生物学、代谢工程等方面有较强的科研背景，有从事信息导向细胞工厂设计与应用的兴趣。
有较强的工作责任心、组织协调能力和团队协作精神；具有独立开展科研工作的能力；有强烈的科研兴趣，语言表达与写作能力较好。
课题组急需多个专业、多种层次人才的加盟。
招生专业
071023-计算生物学
085238-生物工程
085238-生物工程
招生方向
合成生物学
教育背景
2001-09--2004-06 中南大学 博士
1998-09--2001-06 中南大学 硕士
1993-09--1997-07 中南工业大学 学士
1998-09--2001-06 中南大学 硕士
1993-09--1997-07 中南工业大学 学士
学历
学位
工作经历
工作简历
2017-07~现在, 中国科学院上海生命科学研究院, 研究员
2014-11~2017-06,中国科学院天津工业生物技术研究所, 研究员
2010-03~2014-11,武汉大学, 副教授
2008-08~2010-02,京都大学, 产官学研究员
2007-03~2008-07,加州大学尔湾分校, 博士后
2004-10~2007-02,爱尔兰根-纽伦堡大学, 博士后
2014-11~2017-06,中国科学院天津工业生物技术研究所, 研究员
2010-03~2014-11,武汉大学, 副教授
2008-08~2010-02,京都大学, 产官学研究员
2007-03~2008-07,加州大学尔湾分校, 博士后
2004-10~2007-02,爱尔兰根-纽伦堡大学, 博士后
社会兼职
专利与奖励
奖励信息
（1） 中国化学会青年优秀论文奖, , 部委级, 2004
专利成果
出版信息
发表论文
（1） SynBioEcoli a comprehensive metabolism network of engineered E. coli in three dimensional visualization., Quantitative Biology, 2017, 通讯作者
（2） PhID: an open-access integrated pharmacology interactions database for drugs, targets, diseases, genes, side-effects and pathways., Journal of Chemical Information and Modeling, 2017, 通讯作者
（3） EcoSynther: A customized platform to explore biosynthetic potential in E. coli., ACS Chemical Biology, 2017, 通讯作者
（4） Multi-fields modelforpredictingtarget–ligand interaction, Neurocomputing, 2016, 通讯作者
（5） BioSynther: a customized biosynthetic potential explorer, Bioinformatics, 2016, 通讯作者
（6） Predicting target-ligand interactions using protein ligand-binding site and ligand substructures., BMC Syst Biol, 2015, 通讯作者
（7） VNP: Interactive Visual Network Pharmacology of Diseases, Targets, and Drugs., CPT Pharmacometrics Syst Pharmacol, 2014, 第 1 作者
（8） Genome-scale screening of drug-target associations relevant to Ki using a chemogenomics approach., Plos One, 2013, 通讯作者
（9） ChemoPy: freely available python package for computational biology and chemoinformatics., Bioinformatics, 2013, 第 3 作者
（10） Assignment of EC numbers to enzymatic reactions with reaction difference fingerprints., Plos One, 2012, 第 1 作者
（11） RxnFinder: biochemical reaction search engines using molecular structures, molecular fragments and reaction similarity., Bioinformatics, 2011, 第 1 作者
（2） PhID: an open-access integrated pharmacology interactions database for drugs, targets, diseases, genes, side-effects and pathways., Journal of Chemical Information and Modeling, 2017, 通讯作者
（3） EcoSynther: A customized platform to explore biosynthetic potential in E. coli., ACS Chemical Biology, 2017, 通讯作者
（4） Multi-fields modelforpredictingtarget–ligand interaction, Neurocomputing, 2016, 通讯作者
（5） BioSynther: a customized biosynthetic potential explorer, Bioinformatics, 2016, 通讯作者
（6） Predicting target-ligand interactions using protein ligand-binding site and ligand substructures., BMC Syst Biol, 2015, 通讯作者
（7） VNP: Interactive Visual Network Pharmacology of Diseases, Targets, and Drugs., CPT Pharmacometrics Syst Pharmacol, 2014, 第 1 作者
（8） Genome-scale screening of drug-target associations relevant to Ki using a chemogenomics approach., Plos One, 2013, 通讯作者
（9） ChemoPy: freely available python package for computational biology and chemoinformatics., Bioinformatics, 2013, 第 3 作者
（10） Assignment of EC numbers to enzymatic reactions with reaction difference fingerprints., Plos One, 2012, 第 1 作者
（11） RxnFinder: biochemical reaction search engines using molecular structures, molecular fragments and reaction similarity., Bioinformatics, 2011, 第 1 作者
发表著作
