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研究领域

   

招生信息

   
招生专业
071007-遗传学
0710J3-生物信息学
0710Z1-基因组学
招生方向
复杂基因组的精细结构解析
药物基因组学与精准用药指导
生物信息学工具开发与数据库构建

教育背景

1991-09--1996-07   中国农业大学   生物化学专业 获理学博士学位
1987-09--1991-07   天津商学院   食品工程专业 获理学学士学位
学历
   
学位
   

工作经历

   
工作简历
2019-08~现在, 中国科学院微生物研究所, 研究员 博士生导师
2003-02~2019-07,中国科学院北京基因组研究所, 研究员 博士生导师
2002-02~2008-09,浙江大学沃森基因组科学研究院, 教授 硕士生导师
1999-08~2003-02,中国科学院遗传与发育研究所人类基因组中心, 总工程师
1998-08~1999-07,美国西雅图华盛顿大学基因组中心, 访问学者
1996-09~1998-07,中国医学科学院基础医学研究所, 助理研究员
1991-09~1996-07,中国农业大学, 生物化学专业 获理学博士学位
1987-09~1991-07,天津商学院, 食品工程专业 获理学学士学位
社会兼职
   

教授课程

基因组信息系统与实践
基因组学分析技术与原理
基因组学技术与原理
基因组学
基因组学前沿
基因组学实用技术讲座

专利与奖励

   
奖励信息
(1) 河北省科学技术进步三等奖, 三等奖, 省级, 2015
(2) 唐山市科技进步二等奖, 二等奖, 市地级, 2015
(3) 国务院特殊津贴_, 国家级, 2014
(4) 中国科学院朱李月华优秀教师奖, , 院级, 2008
(5) 利用EST信息资源大规模克隆家蚕功能基因 浙江省科学技术一等奖, 一等奖, 省级, 2007
(6) 中国科学院优秀教师奖, , 院级, 2006
(7) 中国杂交水稻基因组计划 中国科学院杰出科技成就集体奖, , 院级, 2003
(8) 中国杂交水稻基因组计划 香港求是科技基金求是杰出科技成就集体奖, , 其他, 2002
专利成果
   

出版信息

   
发表论文
(1) Evolview v3: a webserver for visualization, annotation, and management of phylogenetic trees, Nucleic Acids Res, 2019-07, 第 11 作者
(2) Transcriptomic profiling reveals MEP pathway contributing to ginsenoside biosynthesis in Panax ginseng., BMC Genomics, 2019-05, 第 11 作者
(3) The HuangZaoSi Maize Genome Provides Insights into Genomic Variation and Improvement History of Maize, Mol Plant, 2019-05, 第 11 作者
(4) RGAAT: A Reference-based Genome Assembly and Annotation Tool for New Genomes and Upgrade of Known Genomes, Genomics Proteomics Bioinformatics, 2018-10, 第 11 作者
(5) REDO: RNA Editing Detection in Plant Organelles Based on Variant Calling Results, J Comput Biol., 2018, 第 11 作者
(6) Identification of a G2-like transcription factor, OsPHL3, functions as a negative regulator of flowering in rice by co-expression and reverse genetic analysis., BMC Plant Biol., 2018, 第 11 作者
(7) Tung Tree (Vernicia fordii, Hemsl.) Genome and Transcriptome Sequencing Reveals Co-Ordinate Up-Regulation of Fatty Acid β-Oxidation and Triacylglycerol Biosynthesis Pathways During Eleostearic Acid Accumulation in Seeds., Plant Cell Physiol., 2018, 第 11 作者
(8) Analysis of gut microbiota diversity and auxiliary diagnosis as a biomarker in patients with schizophrenia: A cross-sectional study., Schizophr Res., 2018, 第 11 作者
(9) Rice Expression Database (RED): An integrated RNA-Seq-derived gene expression database for rice, Journal of Genetics and Genomics, 2017, 第 12 作者
(10) Genetic Alterations in Esophageal Tissues From Squamous Dysplasia to Carcinoma, Gastroenterology, 2017, 第 12 作者
(11) DRDB: An Online Date Palm Genomic Resource Database, Front Plant Sci., 2017, 第 11 作者
(12) CYP2A6 Polymorphisms Associate with Outcomes of S-1 Plus Oxaliplatin Chemotherapy in Chinese Gastric Cancer Patients, Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 2017, 第 11 作者
(13) ISVASE: identification of sequence variant associated with splicing event using RNA-seq data, BMC Bioinformatics, 2017, 第 11 作者
(14) A meta-analysis of the association of CKM gene rs8111989 polymorphism with sport performance, Biology of Sport, 2017, 第 11 作者
(15) REDO: RNA Editing Detection in Plant Organelles Based on Variant Calling Results, Journal of Computational Biology, 2017, 第 11 作者
(16) DRDB: An Online Date Palm Genomic Resource Database, Frontiers in Plant Science, 2017, 第 11 作者
(17) MVP: a microbe-phage interaction database, Nucleic Acids Research, 2017, 第 4 作者
(18) Comparative genome analysis of programmed DNA elimination in nematodes, Genome Research, 2017, 第 12 作者
(19) De novo Transcriptome Analysis Reveals Distinct Defense Mechanisms by Young and Mature Leaves of Hevea brasiliensis (Para Rubber Tree), Scientific Reports, 2016, 第 11 作者
(20) Comparative genomics reveals adaptive evolution of Asian tapeworm in switching to a new intermediate host, Nat Commun, 2016, 第 11 作者
(21) Conserved intramolecular interactions maintain myosin interacting-heads motifs explaining tarantula muscle super-relaxed state structural basis, Journal of molecular biology, 2016, 第 11 作者
(22) Information Commons for Rice (IC4R), Nucleic Acids Research, 2016, 第 11 作者
(23) Identification and analysis of house-keeping and tissue-specific genes based on RNA-seq data sets across 15 mouse tissues, Gene, 2016, 第 11 作者
(24) De novo sequencing and transcriptome analysis of Pleurotus eryngii subsp. tuoliensis (Bailinggu) mycelia in response to cold stimulation, Moleculars, 2016, 第 11 作者
(25) Evolview v2: an online visualization and management tool for customized and annotated phylogenetic trees, Nucleic Acids Research, 2016, 第 11 作者
(26) Identification and analysis of mouse non-coding RNA using transcriptome data, Science China. Life Sciences, 2016, 第 11 作者
(27) The rubber tree genome reveals new insights into rubber production and species adaptation, Nature Plants, 2016, 第 11 作者
(28) De novo sequencing and transcriptome analysis of Pleurotus eryngii subsp. tuoliensis (Bailinggu) mycelia in response to cold stimulation, Moleculars, 2016, 第 11 作者
(29) Metatranscriptomic analyses of plant cell wall polysaccharide degradation by microorganisms in cow rumen, Applied and Ennvironmental Microbiology, 2015, 第 11 作者

 

 


 

 

 

 
 
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