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课题组长简介
刘凡,男,中科院北京基因组研究所,中国科学院精准基因组医学重点实验室研究员,中国科学院大学岗位教授,****获得者。1999年在山东大学获得临床医学学士学位。后曾在荷兰伊拉斯谟大学医学中心学习工作13年(2002-2015),先后师从荷兰皇家科学院院士Conelia van Duijn教授和法医分子生物学专家Manfred Kayser教授,获硕士、理学博士、博士学位,从事博士后、Tenure助理教授、博士生导师的工作。2015年2月获国家青年****择优引进,10月份全职加入中国科学院北京基因组研究所,中国科学院精准基因组医学重点实验室任研究员。多年来从事遗传流行病学和基因组学的研究,在人类复杂性状的遗传力和遗传因子领域取得系统性的研究进展。带领研发的推断人类眼睛和头发颜色的两个DNA测试系统已经在国际上被广泛应用于法医检测。共发表五十余篇SCI期刊学术论文,累计他引千余次,其中第一或通讯作者17篇论文发表在Am J Hum Genet、Curr Bio、PLoS Genet、Hum Genet、Forensic Sci Int Genet等领域权威刊物。研究工作国内外同行认可,共有7篇论文被作为亮点报道。申请美国专利2项。研发软件包7项。独立或参与争取欧洲科研经费5项,总计290余万欧元。有多次主持国际合作科研课题,受邀在国际学术会议上作大会报告和主题报告,为Nature、Science等领域权威刊物审稿和文评的经验。
已发表论文详情:http://orcid.org/0000-0001-9241-8161
课题组研究方向
精准医学是医学领域的新兴革命性改革。刘凡课题组结合遗传流行病学、临床医学和生物信息学,利用高通量基因组测序等技术,致力于人类重大疾病的个体化基因组学研究:1)研究人类基因组及各类遗传和非遗传变异的复杂结构;2)研发新算法和流水线来揭示基因组变异和人类复杂性状和疾病之间的关联;3)利用遗传因子和疾病的关系建立精确DNA预测和诊断模型;4)建立大规模健康和专病人群队列,鉴定一批致病遗传因子,结合湿实验功能验证,深入解释重大疾病遗传力的构成。最终达到利用大数据分析和互联网共享,有机整合临床、基因组和其它组学的海量信息,为病人量身设计出最佳的疾病预防、诊断、及治疗方案。课题组研究方向有很强的实用价值,如协助临床诊断,孟德尔疾病产前测试和新生儿筛查,常见病高危人群普查,以及用药后不良反映预估等。除了医药相关的应用,鉴定人类外部可见性状的遗传因子在法医学和人类学等相关领域都有重要的实际应用价值。
精准医学是在大样本研究获得疾病分子机制的知识体系基础上,以生物组学特别是基因组学数据为依据,根据患者个体在基因型、表型、环境和生活方式等各方面特异性,应用现代遗传学、分子影像学、生物信息学和临床医学等方法与手段,整合多组学信息,制定个性化精准预防、诊断、治疗和预后方案。精准医学研究集合了诸多现代医学科技发展的知识与技术体系,体现了医学科学发展趋势,也代表了临床实践的发展方向。
刘凡研究组隶属于中国科学院精准基因组医学重点实验室,于2015年10月组建,以精准基因组医学为研究方向,利用大人群队列样本资源,以重大疾病、罕见病、和人类复杂性状的遗传因子为研究内容,以科研成果转化临床应用落地为最终目标,长期诚聘邻域内有识之士加入,共同发展,协同攻关,为精准医学的全面实现打下坚实的基础。
一、应聘条件:
1. 有生物信息,遗传学,生物统计或数学等相关专业的硕士或博士学位。
2. 至少掌握一门R、Python、Perl、Java或C等编程语言,熟悉Linux系统,具有高通量测序数据分析、人群队列遗传因子研究等相关工作经验者优先考虑。
3. 以第一作者发表过生物信息和遗传相关领域SCI文章。
4. 具有良好的英语阅读、写作和交流能力。
二、招聘岗位及职责:
1. 生物信息工程师:完成课题组长分配的数据处理分析、分析流水线软件开发、数据库维护等任务。
2. 助理研究员:完成课题组长分配的科研课题,协助申请与课题组方向一致的科研课题。自主探索、申请和完成与课题组方向一致的科研课题。协助教学和实验室管理。
3. 博士后:完成课题组长分配的